Hay tres motores de gasolina que cambian. El V6 de 2,8 desaparece y en su lugar está la versión de 3 litros de cilindrada. Es el mismo motor que ha estrenado el A4, que da 220 CV de potencia máxima a 6.300 rpm. Otros V6 que aumentan de potencia son el 2,7 litros turbo, que antes tenía 230 CV y ahora 250; y el 2,4 litros, que pasa de 165 a 170.
En la gama de motores de gasolina hay también un cuatro cilindros con turbo de 150 (una de las mejores elecciones posibles en la gama A6) y el V8 sólo en versión de 4,2 litros (no 3,7). El S6 mantiene el V8 de 340 CV. Salvo éste y el V6 Turbo, todos pueden cumplir la norma Euro 4 de emisiones.
De los motores de gasolina, los dos V6 menos potentes y el cuatro cilindros pueden tener cambio de variador Multitronic. Los demás llevan una nueva versión de la caja automática Tiptronic, con mandos secuenciales en el volante y un nuevo control electrónico, que tiene un programa de funcionamiento «deportivo».